《同根生》讲述的是发生在六二年的大逃亡潮中的故事。影片的主人公是刘德华和林威饰演的两兄弟,他们失散了。其中一位被遣返回大陆进行劳改,另一位则被救起并带到香港。他们结为夫妻并开始过正常的生活。其中一位成为台湾养鱼业及船务商人,而另一位则被犯罪集团雇用来港参加打劫,并被指使前往。故事中充满了浪漫和惊险,展现出两兄弟面临的各种挑战,以及他们如何度过大逃亡潮期间的生活。